¿Qué es la metagenómica? @DoctorGenoma nos lo explica

En el marco de la la II Semana de la ciencia de Astorga  se desarrolló una charla sobre Metagenómica a cargo de Raùl de la Puente, conocido en las redes sociales como @DoctorGenoma.  Autor además del Blog de Laboratorio (por cierto super recomendable).

La charla està en lenguaje bastante simple para que sea accesible para todos.

Espero les guste y visiten mas seguido su Blog

Felicitaciones Raùl!

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Una nueva forma de secuenciar el ADN

Imágen de genoma_ciencia-de-ecodiario

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Se ha publicado en Nature, una de las revistas de ciencia de mayor prestigio en todo el mundo, una nueva forma de secuenciar el ADN. La metodología antigua se basaba en la síntesis de una nueva cadena de ADN de lo que se quería secuenciar con una marcación fluorescente que podía leer un aparato y enviarlo a una pantalla en colores, donde cada base registraba un pico de cada color (negro, azul rojo y verde) pero ahora se propone una nueva técnica mucho más simple y rápida . Esa técnica descrita por Frederik  Sanger le otorgó al investigador su premio Nobel en 1980.

Sec Automat1 de ucm.es

De acuerdo a lo relatado en Techonolgy review esta nueva técnica usa un material especial (el grafeno).

Las capas de grafeno de sólo un átomo de grosor podrían ayudar a que la secuenciación del ADN humano fuera más rápida y barata. Un grupo de investigadores de la Universidad de Harvard y el MIT han demostrado que las hojas de grafeno podrían suponer una gran mejora con respecto a las membranas que se utilizan actualmente para la secuenciación por nanoporos—una técnica que promete acelerar y simplificar la secuenciación de largas cadenas de ADN.

una-secuencia-de-adn de gattaca.com.ar

Hoy día las técnicas de secuenciación de ADN consisten en el corte del ADN, la creación de muchas copias de las piezas, y la lectura de moléculas fluorescentes unidas a ellas. Este enfoque lleva días y cuesta decenas de miles de dólares. Por el contrario, la secuenciación por nanoporos podría, en teoría, analizar un genoma humano completo en pocas horas.

La secuenciación por nanoporos consiste en tirar de una cadena de ADN a través de un pequeño agujero en una membrana suspendida en una solución salina con un voltaje aplicado a través de ella. Los iones que se desplazan de un lado de la membrana al otro crean una corriente eléctrica. Al tiempo que cada una de las cuatro bases de ADN diferentes pasan a través del poro, la intensidad de la corriente disminuye en un grado diferente, lo que permite una rápida secuenciación de las bases.

Los nanoporos utilizados actualmente para la secuenciación de ADN se crean normalmente a partir de proteínas bacterianas o están grabados en membranas de nitruro de silicio. Estas membranas tienen entre 20 y 30 nanómetros de espesor. Sin embargo, puesto que la distancia entre dos bases de ADN es de 0,5 nanómetros, entre 40 a 60 bases podrían quedar atrapadas en los poros a la vez.

Una membrana más delgada, como el grafeno, podría permitir una identificación más precisa de las bases. Una única capa de grafeno es de sólo un nanómetro de espesor. Es “la membrana más delgada que jamás se haya aplicado a este problema”, afirma Jene Golovchenko, profesor de física de Harvard que dirigió el nuevo trabajo, publicado en la revista Nature.

Para más información seguir leyendo aquí

¿Como empieza la historia de la Genética?

Esquema conceptual de la idea del blog (elaborado en CMAP tools TM)

Empecemos por el principio…Gregor Mendel en 1866 enuncia las tres leyes de la herencia, es decir explica como se transmiten las características de una generación a otra, aún sin saber que existían las gametas (ovocitos y espermatozoides). Por esto es más valiosa aún su visión. Así nace la Genética como ciencia. Es la ciencia que estudia la transmisión de las características, es decir las cualidades propias de cada individuo que son debidas a los genes (unidades de información en el ADN que luego se transforman en proteínas responsables de dichas características). Pueden ser el color de ojos, color de la piel, el tipo de proteínas que poseemos para distintas rutas metabólicas, el peso al nacimiento, etc.
Repasemos un poco la historia
La idea de este Blog es generar un espacio para acceder a los conocimientos de la biología molecular y su uso en la genética con sus diversas aplicaciones.

Durante la construcción de este Blog se podrá acceder a videos, fotos, comentarios, etc.y/o publicaciones de interés.

La Genética molecular aparece desde el descubrimiento de la doble hélice de ADN de Watson y Crick en 1954 . Luego Francis Crick continúa con el descubrimiento del código genético en los 60’s. Es decir se descubrió que las bases del ADN se leen de a 3, y tres combianciones de letras significan un aminoácido que formará parte de una proteína. Allí comienza a comprenderse como es la molécula de ADN y como lleva la información que contiene a la célula que la contiene. A esto se lo denominó “Dogma central de la biología molecular”.

Luego aparece el descubrimiento de las
enzimas de restricción que permiten cortar el ADN y así analizarlo. Nace allí la ingeniería genética. Eso permitió cortar y pegar a la molécula de ADN para estudiarla, analizar patologías en ciertos genes, etc. Hasta que, hacia fines de los 80’s, Karl Mullis descubre la técnica de PCR que revolucionó a la genética por su paracticidad y rapidez para amplificar una region de ADN en cantidad suficiente para luego hacer todo tipo de análisis.

Aqui les dejo un video sobre la técnica.


http://www.youtube.com/get_player