Detectives moleculares de alimentos. Ejercitación resuelta

Introducción: Las aplicaciones de la técnica de PCR en el control de alimentos son numerosas. Se pueden utilizar para identificar especies cárnicas y especies de pescado de interés alimenticio, detectar la presencia de agentes patógenos en los alimentos (Salmonella spp., Listeria monocytogenes, Escherichia coli O157:H7) o detectar la presencia o ausencia de organismos genéticamente modificados (OGMs) en los alimentos.

En la siguiente figura se muestra el resultado obtenido al amplificar por PCR un gen universal presente en todas las especies animales. En este ensayo, cada especie genera una banda de amplificación de un tamaño determinado.

En la Figura 1 puede observar que las calles control (1 a 6) correspondientes a cabra, pollo, vaca, oveja, cerdo y caballo pueden compararse con las muestras problema (calles 7 a 12). Las calles 7 a 12 corresponden a distintos alimentos, en los cuales se quiere determinar qué tipo de carne poseen.

gel agarosa

Teniendo en cuenta el tamaño relativo de los genes amplificados en las muestras control, ¿podría decir qué producto animal poseen los alimentos A (calles 7 y 8), B (calles 9 y 10) y C (calles 11 y 12)?

ACTIVIDAD RESUELTA

Respuestas:  Al comparar los tamaños alélicos, se puede concluir que:

  • La muestra A (calles 7 y 8) contiene pollo,
  • La muestra B (calles 9 y 10) contiene en su composición carne de pollo, vaca y cerdo.
  • La muestra C (calles 11 y 12), al igual que la muestra A, contiene sólo carne de pollo.

Tiene razón la OMS o la ECDC? E. Coli y epidemia en Europa

Les copio un artículo del diario El Mundo para que lean las ultimas noticias de la bacteria E. coil y el brote en Europa

La Organización Mundial de la Salud ha señalado que la bacteria de ‘E. coli’ que ha causado ya al menos 17 muertes en Europa corresponde a una cepa nunca vista antes, lo que contradice la información de los Centros Europeos de las Enfermedades (ECDC) que en un informe a petición de la Comisión Europea señalaban a esta misma cepa como causante de un brote en Corea en el año 2005 y de ocho casos en territorio europeo en 2008.

Según la OMS, sin embargo, la secuenciación genética preliminar del patógeno señalaría dos mutaciones en genes clave que explicarían por qué el actual brote en Centroeuropa está resultando tan letal.

“Se trata de una cepa única que nunca antes se había aislado en pacientes”, ha señalado Hilde Kruse, especialista en seguridad alimentaria del organismo a la agencia Ap; “con varias características que la hacen más virulenta y capaz de producir toxinas”.
Resistencia a los antibióticos

Una idea en la que han coincidido investigadores del Instituto de Genómica de Pekín, que están colaborando con la Universidad alemana de Hamburg-Eppendorf. Tres días después de recibir muestras de ‘E. coli’ para su análisis, los científicos chinos han señalado que se trata de una nueva cepa, altamente infecciosa.

En un comunicado, aseguran que el patógeno que está actuando en Centroeuropa comparte un 93% de similitudes genéticas con otra variedad de ‘E. coli’ denominada EAEC 55989, aislada hasta la fecha en África central y relacionada con casos graves de diarrea.

“La secuenciación del genoma indica que se trata de una cepa 0104, pero de un serotipo nunca antes implicado en brotes de ‘E. coli'”, señala el instituto chino. “Esta nueva cepa ha adquirido secuencias específicas, similares a las implicadas en la patogenicidad y colitis hemorrágica y en el síndrome hemolítico urémico”, añaden.

Para finalizar sus hallazgos añaden que las técnicas de ADN también han revelado que la mortal cepa porta varios genes que le confieren resistencia a los antibióticos, incluidos los aminoglicósidos, macrólidos y beta-lactámicos, todo lo cuál dificulta el tratamiento.
1.500 afectados

Hasta la fecha, la cepa en cuestión ha infectado a más de 1.500 personas en nueve países de toda Europa (Austria, Dinamarca, Francia, Países Bajos, Noruega, España, Suecia, Suiza y Reino Unido), casi 500 de las cuales han desarrollado complicaciones renales. Todos ellos, incluidos los tres afectados que también ha registrado EEUU, habían viajado recientemente a Alemania, donde parece ubicarse el epicentro del problema. Aunque una vez descartada la ‘culpabilidad’ de los pepinos españoles, los investigadores siguen sin localizar en qué alimento se encuentra el origen del brote.

Por ahora, el brote de ‘E. coli’ es considerado el tercero más grave de la historia, aunque puede ser el de mayor mortalidad. En el año 1996, 12 personas fallecieron en Japón por una cepa diferente de esta misma bacteria, que infectó a más de 12.000 japoneses. Por otro lado, en el año 2000, el mismo patógeno causó siete víctimas mortales en Canadá.

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